El tema de este artículo es parte del debate sobre la interdisciplinariedad en la investigación y el posgrado, con un enfoque en las Ciencias Ambientales. Tiene como objetivo presentar las discusiones acerca de la institucionalización de la interdisciplinariedad y de las Ciencias Ambientales en cursos de posgrado brasileños, teniendo en cuenta la experiencia de los autores, el análisis documental y la revisión de la literatura. Con base en los datos de la evolución del posgrado brasileño, se presenta la institucionalización y se discute la práctica interdisciplinaria en la investigación del posgrado en Ciencias Ambientales, mostrando caminos y desafíos para el futuro próximo.