Este artículo tiene como objetivo presentar las experiencias relacionadas con la instrumentación de diferentes resultados de investigación y transferencia obtenidos por equipos de la Maestría de Estudios Fronterizos (MEF) de la Universidad Federal de Mato Grosso do Sul (Brasil) y la Maestría en Antropología Social de la Facultad de Filosofía y Letras de la Universidad de Buenos Aires (Argentina). Abordamos aquí las experiencias de investigaciones aplicadas por equipos de ambos programas de postgrado, profundizando en la forma en que la alianza establecida – centrada en la temática de las “fronteras” – a partir del proyecto financiado por CAPES (Brasil) y SPU (Argentina) ha dado lugar a mejoras en las herramientas metodológicas utilizadas en las actividades de investigación. Tratamos en este escrito una serie de reflexiones que permiten comparar las experiencias desarrolladas en ambos programas de postgrado. Por un lado, con los investigadores de Argentina (de la UBA), con relación a los pueblos indígenas en contextos de frontera se busca desde el ámbito de aplicación afrontar diversos problemas que demanda la comunidad. Por otro lado, con el trabajo desarrollado en Brasil (por el MEF) con las instituciones y organismos que trabajan directamente con los inmigrantes en la región fronteriza, de la misma manera se busca aplicar y transferir las investigaciones y resultados.